MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-85

Total Repeats: 1964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020383	T	6	6	1	6	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020383	TAGA	2	8	66	73	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020383	ACC	2	6	83	88	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_020383	TAA	2	6	132	137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020383	TGA	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020383	TTC	2	6	178	183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020383	GTA	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020383	TTA	2	6	208	213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020383	AGG	2	6	220	225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020383	ACA	2	6	226	231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020383	TAAACA	2	12	292	303	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452202279
12	NC_020383	AAG	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202279
13	NC_020383	AAT	2	6	427	432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202279
14	NC_020383	ATT	2	6	456	461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202279
15	NC_020383	ATTCG	2	10	605	614	20 %	40 %	20 %	20 %	452202279
16	NC_020383	TTG	2	6	621	626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202279
17	NC_020383	GTAA	2	8	692	699	50 %	25 %	25 %	0 %	452202279
18	NC_020383	CTT	2	6	789	794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202279
19	NC_020383	TGA	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202279
20	NC_020383	AAT	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202279
21	NC_020383	GAA	2	6	895	900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202279
22	NC_020383	CAA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202279
23	NC_020383	ATCAA	2	10	1014	1023	60 %	20 %	0 %	20 %	452202279
24	NC_020383	GAA	3	9	1031	1039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202279
25	NC_020383	TTC	2	6	1246	1251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202279
26	NC_020383	GGC	2	6	1276	1281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202279
27	NC_020383	ACT	2	6	1350	1355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202279
28	NC_020383	TCC	2	6	1435	1440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202279
29	NC_020383	T	7	7	1471	1477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020383	T	6	6	1507	1512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020383	ATTT	2	8	1594	1601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020383	T	6	6	1621	1626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020383	AATTTA	2	12	1663	1674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020383	TA	3	6	1678	1683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020383	T	6	6	1709	1714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020383	T	6	6	1723	1728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020383	A	6	6	1737	1742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020383	T	6	6	1761	1766	0 %	100 %	0 %	0 %	452202280
39	NC_020383	CT	3	6	1851	1856	0 %	50 %	0 %	50 %	452202280
40	NC_020383	AT	3	6	1892	1897	50 %	50 %	0 %	0 %	452202280
41	NC_020383	ATC	2	6	1926	1931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202280
42	NC_020383	T	6	6	1986	1991	0 %	100 %	0 %	0 %	452202280
43	NC_020383	AT	3	6	2060	2065	50 %	50 %	0 %	0 %	452202280
44	NC_020383	T	6	6	2103	2108	0 %	100 %	0 %	0 %	452202280
45	NC_020383	ACT	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202280
46	NC_020383	TCT	2	6	2204	2209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202280
47	NC_020383	TTC	2	6	2217	2222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202280
48	NC_020383	TAG	2	6	2273	2278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202280
49	NC_020383	ATG	2	6	2369	2374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202280
50	NC_020383	ATTTT	2	10	2390	2399	20 %	80 %	0 %	0 %	452202280
51	NC_020383	TTC	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202280
52	NC_020383	ATA	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202280
53	NC_020383	TAT	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020383	ATTT	2	8	2498	2505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020383	A	6	6	2518	2523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020383	A	8	8	2560	2567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020383	ATA	2	6	2644	2649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020383	A	6	6	2686	2691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020383	A	6	6	2814	2819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020383	GATT	2	8	2855	2862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020383	TAT	2	6	2941	2946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020383	TTA	3	9	2948	2956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020383	TA	3	6	2965	2970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020383	ATT	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202281
65	NC_020383	TTA	2	6	3041	3046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202281
66	NC_020383	AGA	2	6	3084	3089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202281
67	NC_020383	AGC	2	6	3121	3126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202281
68	NC_020383	GAA	3	9	3195	3203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202281
69	NC_020383	GAAG	2	8	3224	3231	50 %	0 %	50 %	0 %	452202281
70	NC_020383	TTA	2	6	3260	3265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202281
71	NC_020383	GAAG	2	8	3284	3291	50 %	0 %	50 %	0 %	452202281
72	NC_020383	T	6	6	3318	3323	0 %	100 %	0 %	0 %	452202282
73	NC_020383	A	6	6	3415	3420	100 %	0 %	0 %	0 %	452202282
74	NC_020383	ATT	2	6	3457	3462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202282
75	NC_020383	AT	3	6	3495	3500	50 %	50 %	0 %	0 %	452202282
76	NC_020383	TA	3	6	3519	3524	50 %	50 %	0 %	0 %	452202282
77	NC_020383	AGA	2	6	3563	3568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202282
78	NC_020383	TGA	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202282
79	NC_020383	TCT	2	6	3586	3591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202282
80	NC_020383	ATT	2	6	3613	3618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202282
81	NC_020383	TTTGG	2	10	3643	3652	0 %	60 %	40 %	0 %	452202282
82	NC_020383	ATT	2	6	3734	3739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202282
83	NC_020383	TGTT	2	8	3799	3806	0 %	75 %	25 %	0 %	452202282
84	NC_020383	T	7	7	3805	3811	0 %	100 %	0 %	0 %	452202282
85	NC_020383	TAT	2	6	3873	3878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020383	ATA	2	6	3907	3912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020383	ATA	2	6	3955	3960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020383	TCA	2	6	3994	3999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020383	T	6	6	4000	4005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020383	TCT	2	6	4149	4154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202283
91	NC_020383	TTA	2	6	4165	4170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202283
92	NC_020383	CTTT	2	8	4245	4252	0 %	75 %	0 %	25 %	452202284
93	NC_020383	ATTA	2	8	4276	4283	50 %	50 %	0 %	0 %	452202284
94	NC_020383	A	6	6	4318	4323	100 %	0 %	0 %	0 %	452202284
95	NC_020383	AGT	2	6	4367	4372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202284
96	NC_020383	TAC	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202284
97	NC_020383	A	6	6	4396	4401	100 %	0 %	0 %	0 %	452202284
98	NC_020383	A	7	7	4466	4472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020383	ATA	2	6	4488	4493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020383	A	6	6	4537	4542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020383	A	6	6	4546	4551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020383	TAAG	2	8	4563	4570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020383	ATTT	2	8	4604	4611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020383	AT	3	6	4629	4634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020383	TTA	2	6	4746	4751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020383	T	6	6	4773	4778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020383	TTA	2	6	4913	4918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020383	TAT	2	6	5002	5007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020383	GAG	2	6	5008	5013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020383	ATT	2	6	5081	5086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020383	TGA	2	6	5087	5092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020383	T	6	6	5132	5137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020383	AGAT	2	8	5171	5178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020383	GAT	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202285
115	NC_020383	AAGAAA	2	12	5286	5297	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452202285
116	NC_020383	A	6	6	5300	5305	100 %	0 %	0 %	0 %	452202285
117	NC_020383	T	7	7	5337	5343	0 %	100 %	0 %	0 %	452202285
118	NC_020383	TTGA	2	8	5357	5364	25 %	50 %	25 %	0 %	452202285
119	NC_020383	A	8	8	5383	5390	100 %	0 %	0 %	0 %	452202285
120	NC_020383	AATG	2	8	5393	5400	50 %	25 %	25 %	0 %	452202285
121	NC_020383	AAT	2	6	5419	5424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202285
122	NC_020383	AATCT	2	10	5463	5472	40 %	40 %	0 %	20 %	452202285
123	NC_020383	TGT	2	6	5482	5487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202285
124	NC_020383	TGG	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202285
125	NC_020383	TAAA	2	8	5511	5518	75 %	25 %	0 %	0 %	452202285
126	NC_020383	GTA	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202285
127	NC_020383	ATG	2	6	5658	5663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202285
128	NC_020383	GAA	2	6	5668	5673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202285
129	NC_020383	ACA	2	6	5674	5679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202285
130	NC_020383	ATTT	2	8	5682	5689	25 %	75 %	0 %	0 %	452202285
131	NC_020383	A	6	6	5717	5722	100 %	0 %	0 %	0 %	452202285
132	NC_020383	TA	3	6	5724	5729	50 %	50 %	0 %	0 %	452202285
133	NC_020383	CTT	2	6	5734	5739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202285
134	NC_020383	AAT	2	6	5759	5764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202285
135	NC_020383	T	6	6	5766	5771	0 %	100 %	0 %	0 %	452202285
136	NC_020383	TAG	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202285
137	NC_020383	TGT	2	6	5853	5858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202285
138	NC_020383	A	6	6	5861	5866	100 %	0 %	0 %	0 %	452202285
139	NC_020383	ATT	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202285
140	NC_020383	ATA	2	6	5919	5924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202285
141	NC_020383	A	6	6	5958	5963	100 %	0 %	0 %	0 %	452202285
142	NC_020383	GAT	2	6	5996	6001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202285
143	NC_020383	A	6	6	6019	6024	100 %	0 %	0 %	0 %	452202285
144	NC_020383	TGG	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202285
145	NC_020383	TAA	3	9	6103	6111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202285
146	NC_020383	TAT	2	6	6128	6133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202285
147	NC_020383	CT	3	6	6145	6150	0 %	50 %	0 %	50 %	452202285
148	NC_020383	AT	3	6	6229	6234	50 %	50 %	0 %	0 %	452202285
149	NC_020383	ATTT	2	8	6258	6265	25 %	75 %	0 %	0 %	452202285
150	NC_020383	TTC	2	6	6305	6310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202285
151	NC_020383	AAG	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202285
152	NC_020383	TTTCT	2	10	6357	6366	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_020383	CT	3	6	6395	6400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_020383	AAG	2	6	6443	6448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020383	A	6	6	6491	6496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020383	T	7	7	6503	6509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020383	TA	3	6	6521	6526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020383	AGATA	2	10	6531	6540	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020383	TAA	2	6	6594	6599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202286
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163	NC_020383	TAT	2	6	6719	6724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202286
164	NC_020383	TAA	2	6	6725	6730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202286
165	NC_020383	TTG	2	6	6831	6836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202286
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170	NC_020383	AAT	2	6	6913	6918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202286
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172	NC_020383	AAC	2	6	6978	6983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202286
173	NC_020383	A	6	6	7004	7009	100 %	0 %	0 %	0 %	452202286
174	NC_020383	AGAA	2	8	7011	7018	75 %	0 %	25 %	0 %	452202286
175	NC_020383	ATA	2	6	7028	7033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202286
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179	NC_020383	AAT	2	6	7158	7163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202286
180	NC_020383	TA	3	6	7195	7200	50 %	50 %	0 %	0 %	452202286
181	NC_020383	TA	4	8	7205	7212	50 %	50 %	0 %	0 %	452202286
182	NC_020383	A	7	7	7252	7258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_020383	AAC	2	6	7291	7296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202287
184	NC_020383	TCA	2	6	7313	7318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202287
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187	NC_020383	GATT	2	8	7373	7380	25 %	50 %	25 %	0 %	452202287
188	NC_020383	TTA	2	6	7386	7391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202287
189	NC_020383	AT	5	10	7408	7417	50 %	50 %	0 %	0 %	452202287
190	NC_020383	ATA	2	6	7426	7431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202287
191	NC_020383	TCT	2	6	7445	7450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202287
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217	NC_020383	A	7	7	8612	8618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
218	NC_020383	TATAA	2	10	8665	8674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
219	NC_020383	A	6	6	8673	8678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_020383	TTC	2	6	8682	8687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
221	NC_020383	T	6	6	8701	8706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_020383	GTT	2	6	8715	8720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
223	NC_020383	TACT	2	8	8768	8775	25 %	50 %	0 %	25 %	452202290
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235	NC_020383	TGA	2	6	9136	9141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202290
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238	NC_020383	T	7	7	9294	9300	0 %	100 %	0 %	0 %	452202291
239	NC_020383	GTT	2	6	9325	9330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202291
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241	NC_020383	TCCA	2	8	9390	9397	25 %	25 %	0 %	50 %	452202291
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247	NC_020383	A	6	6	9577	9582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_020383	TAA	2	6	9615	9620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202292
249	NC_020383	TAG	2	6	9792	9797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_020383	ACG	2	6	9851	9856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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266	NC_020383	TAAA	2	8	10408	10415	75 %	25 %	0 %	0 %	452202293
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268	NC_020383	TTC	2	6	10648	10653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202293
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270	NC_020383	TCA	2	6	10709	10714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_020383	ATT	2	6	10775	10780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_020383	T	6	6	10828	10833	0 %	100 %	0 %	0 %	452202294
273	NC_020383	CTT	2	6	10834	10839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202294
274	NC_020383	AGATT	2	10	10864	10873	40 %	40 %	20 %	0 %	452202294
275	NC_020383	T	6	6	10883	10888	0 %	100 %	0 %	0 %	452202294
276	NC_020383	ATCT	2	8	10904	10911	25 %	50 %	0 %	25 %	452202294
277	NC_020383	TAC	2	6	10924	10929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202294
278	NC_020383	ATAAA	2	10	10939	10948	80 %	20 %	0 %	0 %	452202294
279	NC_020383	ATAA	2	8	11037	11044	75 %	25 %	0 %	0 %	452202294
280	NC_020383	TGT	2	6	11064	11069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202294
281	NC_020383	ATGAA	2	10	11075	11084	60 %	20 %	20 %	0 %	452202294
282	NC_020383	CAA	2	6	11113	11118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202294
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289	NC_020383	AAATAA	2	12	11519	11530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_020383	GCTG	2	8	11683	11690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
292	NC_020383	GAA	2	6	11741	11746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_020383	TAA	2	6	12669	12674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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